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《企業(yè)所得稅核定征收辦法(試行)》(國稅發(fā)[2008]30號，以下簡稱國稅發(fā)[2008]30號)第三條規(guī)定，納稅人具有下列情形之一的，核定征收企業(yè)所得稅：(一)依照法律、行政法規(guī)的規(guī)定可以不設(shè)置賬簿的;(二)依照法律、行政法規(guī)的規(guī)定應(yīng)當(dāng)設(shè)置但未設(shè)置賬薄的;(三)擅自銷毀賬簿或者拒不提供納稅資料的;(四)雖設(shè)置賬簿，但賬目混亂或者成本資料、收入憑證、費(fèi)用憑證殘缺不全，難以查賬的;(五)發(fā)生納稅義務(wù)，未按照規(guī)定的期限辦理納稅申報，經(jīng)稅務(wù)機(jī)關(guān)責(zé)令限期申報，逾期仍不申報的;(六)申報的計稅依據(jù)明顯偏低，又無正當(dāng)理由的。

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國稅發(fā)[2008]30號第四條規(guī)定，稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)根據(jù)納稅人具體情況，對核定征收企業(yè)所得稅的納稅人，核定應(yīng)稅所得率或者核定應(yīng)納所得稅額。具有下列情形之一的，核定其應(yīng)稅所得率：(一)能正確核算(查實)收入總額，但不能正確核算(查實)成本費(fèi)用總額的;(二)能正確核算(查實)成本費(fèi)用總額，但不能正確核算(查實)收入總額的;(三)通過合理方法，能計算和推定納稅人收入總額或成本費(fèi)用總額的。納稅人不屬于以上情形的，核定其應(yīng)納所得稅額。

《企業(yè)所得稅法實施條例》第十條規(guī)定，《企業(yè)所得稅法》第五條所稱虧損，是指企業(yè)依照《企業(yè)所得稅法》和本條例的規(guī)定將每一納稅年度的收入總額減除不征稅收入、免稅收入和各項扣除后小于零的數(shù)額。

根據(jù)以上規(guī)定，無論采用核定應(yīng)稅所得率方法，還是核定應(yīng)納所得稅額方法，被核定企業(yè)核算的收入和成本費(fèi)用數(shù)據(jù)，至少有一項是不真實的，只要有一項真實，其所形成的虧損乃至向以后年度結(jié)轉(zhuǎn)到的虧損額也不是真實的，不真實的虧損額不可以在以后年度的稅前利潤進(jìn)行彌補(bǔ)。例如：《廣州市地方稅務(wù)局企業(yè)所得稅核定征收工作指引》(穗地稅發(fā)[2008]173號)第二十一條規(guī)定，由核定征收方式改為查賬征收方式的納稅人，其核定征收年度的虧損不得在查賬征收年度結(jié)轉(zhuǎn)彌補(bǔ)。

由此可見，企業(yè)所得稅征收方式從核定征收轉(zhuǎn)為查賬征收后，核定征收期間的成本、收入核算不真實所形成的虧損不可以在轉(zhuǎn)為查賬征收期間的稅前利潤進(jìn)行彌補(bǔ)。

(一)核定征收年度發(fā)生的支出，在轉(zhuǎn)為查賬征收年度才收到發(fā)票的增值稅的處理：不可以抵扣增值稅進(jìn)項稅額

《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于全面推開營業(yè)稅改征增值稅試點的通知》(財稅[2016]36號，以下簡稱財稅[2016]36號)附件1：《營業(yè)稅改征增值稅試點實施辦法》(以下簡稱附件1)第三十三條規(guī)定：“有下列情形之一者，應(yīng)當(dāng)按照銷售額和增值稅稅率計算應(yīng)納稅額，不得抵扣進(jìn)項稅額，也不得使用增值稅專用發(fā)票：(一)一般納稅人會計核算不健全，或者不能夠提供準(zhǔn)確稅務(wù)資料的?！薄对鲋刀惏l(fā)票開具指南》第二章第一節(jié)第十條第(一)項規(guī)定：“一般納稅人有下列情形之一的，不得使用增值稅專用發(fā)票：(一)會計核算不健全，不能向稅務(wù)機(jī)關(guān)準(zhǔn)確提供增值稅銷項稅額、進(jìn)項稅額、應(yīng)納稅額數(shù)據(jù)及其他有關(guān)增值稅稅務(wù)資料的。上列其他有關(guān)增值稅稅務(wù)資料的內(nèi)容，由省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市國家稅務(wù)局確定?！必敹怺2016]36號文件附件1第一章第一節(jié)第四條第二款規(guī)定;“會計核算健全，是指能夠按照國家統(tǒng)一的會計制度規(guī)定設(shè)置賬簿，根據(jù)合法、有效憑證核算。”

基于以上稅收政策規(guī)定，核定征收企業(yè)所得稅的企業(yè)，雖然建賬核算，但是由于賬務(wù)上好多是白條入賬，沒有發(fā)票，成本核算不準(zhǔn)確，不能向稅務(wù)機(jī)關(guān)準(zhǔn)確提供增值稅銷項稅額、進(jìn)項稅額、應(yīng)納稅額數(shù)據(jù)。因此，核定征收企業(yè)所得稅的企業(yè)在核定征收年度不得使用增值稅專用發(fā)票，即使取得了增值稅專用發(fā)票，也不可以抵扣增值稅進(jìn)項稅。于是，在核定征收年度發(fā)生的成本支出，在轉(zhuǎn)為查賬征收年度才收到的增值稅發(fā)票也不可以抵扣增值稅進(jìn)項稅額。

(二)核定征收年度發(fā)生的支出，在轉(zhuǎn)為查賬征收年度的企業(yè)所得稅的處理：不可以企業(yè)所得稅前扣除

《企業(yè)所得稅法實施條例》第九條規(guī)定，企業(yè)應(yīng)納稅所得額的計算，以權(quán)責(zé)發(fā)生制為原則，屬于當(dāng)期的收入和費(fèi)用，不論款項是否收付，均作為當(dāng)期的收入和費(fèi)用;不屬于當(dāng)期的收入和費(fèi)用，即使款項已經(jīng)在當(dāng)期收付，均不作為當(dāng)期的收入和費(fèi)用。由于在按收入總額核定定率和按核定定額征收企業(yè)所得稅的情況下，其成本費(fèi)用支出額、扣除額都是不真實的。根據(jù)收入費(fèi)用配比原則，對在核定征收期間虛增或者應(yīng)轉(zhuǎn)未轉(zhuǎn)、少轉(zhuǎn)的成本費(fèi)用不能結(jié)轉(zhuǎn)到查賬征收期間扣除，具體內(nèi)容如下：

第一，已列支應(yīng)扣除未扣除的成本費(fèi)用不能結(jié)轉(zhuǎn)到查賬征收期間扣除。如在核定征收期間未提足的固定資產(chǎn)、無形資產(chǎn)、生物資產(chǎn)折舊以及商品生產(chǎn)或者購進(jìn)成本、開辦費(fèi)、新產(chǎn)品新技術(shù)研究開發(fā)費(fèi)及其加計扣除部分、待攤費(fèi)用、廣告和業(yè)務(wù)宣傳費(fèi)、職工教育經(jīng)費(fèi)支出等等。

第二，虛列的成本費(fèi)用不能結(jié)轉(zhuǎn)到查賬征收期間扣除。包括無憑證和以非法憑證列支的成本費(fèi)用，如白條、非法發(fā)票和不符合規(guī)定的發(fā)票、非資產(chǎn)評估機(jī)構(gòu)出具的評估報告等等。

第三，應(yīng)列支未列支的期間費(fèi)用不能結(jié)轉(zhuǎn)到查賬征收期間扣除。包括已開具發(fā)票未列支和實際業(yè)務(wù)已發(fā)生但未開具發(fā)票也未列支兩部分，如：管理費(fèi)用、銷售費(fèi)用、財務(wù)費(fèi)用以及應(yīng)由已售出貨物或已提折舊負(fù)擔(dān)的應(yīng)記入成本的采購費(fèi)用、運(yùn)輸費(fèi)用、維護(hù)維修費(fèi)用等。